Jak finansowanie społecznościowe i badania typu open source będą walczyć z rakiem
Źródło: Indysci.org
Co w przypadku raka oznacza podejście badawcze typu open source? W jaki sposób finansowanie społecznościowe pomoże szybciej opracować lepsze leki? W jaki sposób udostępnienie każdemu danych projektu badawczego otworzy nowe możliwości dla badań i innowacji? Chemik, który od dzieciństwa pisze oprogramowanie, chce się tego dowiedzieć.
Naukowiec o nazwisku Isaac Yonemoto stosuje niektóre koncepcje inicjatyw oprogramowania open source do badań nad rakiem. Yonemoto podejmuje się przedsięwzięcia Projekt Marilyn , kampania mająca na celu opracowanie nieopatentowanego leku przeciwnowotworowego. Projekt wskrzesza badania nad związkiem przeciwnowotworowym zwanym 9-deoksybiromycyną , lub 9DS, który okazał się skuteczny przeciwko kilku typom raka we wczesnych testach. Projekt Marilyn ma również na celu zmianę sposobu badania i uwalniania leków. Plik Propozycja projektu wyjaśnia:
„Celem społecznym jest wykazanie, że stosowane badania farmaceutyczne mogą być finansowane przy użyciu modelu finansowania społecznościowego, a ich wyniki mogą być upublicznione bez opatentowania. Ostatecznie celem społecznym jest zachęcenie producentów do niedrogiego wytwarzania leków, poprawiając dostęp do tych leków ”.
Sybiromycyna, macierzysty związek 9DS, została pierwotnie zbadana w latach siedemdziesiątych XX wieku przez syberyjskich naukowców, którzy sądzili, że może ona leczyć raka. „Jest to toksyczny związek wytwarzany przez bakterie glebowe i działa poprzez zatrzymywanie replikacji DNA. Dlatego ma potencjał jako chemioterapeutyk przeciwnowotworowy ”, wyjaśnia propozycję Projektu Marilyn. Jednak odkryli, że ma działanie kardiotoksyczne, powodując stres w sercu i zaprzestali badań. Projekt 9DS został opracowany przez Barbarę Gerratana z University of Maryland w College Park, kiedy opracowała metodę wytwarzania analogów sybiromycyny bez atomu tlenu, o którym sądzono, że powoduje kardiotoksyczność. Usunięcie cząsteczki tlenu wyeliminowało skutki uboczne i faktycznie zwiększyło skuteczność leku.
Gerratana podjął wówczas pracę w Narodowym Instytucie Zdrowia i nie był w stanie kontynuować badań. Firmy farmaceutyczne raczej nie sponsorowały badania, ponieważ opublikowała już swoje wyniki bez patentu. Ale ponieważ dzieło nie zostało opatentowane, jest teraz w domenie publicznej. I tu pojawia się Yonemoto. „Po co robić narkotyki bez patentów?” Strona internetowa Indysci.org pyta.
„Kiedy Salk i Sabin wyleczyli polio, nie opatentowali szczepionki. Nadszedł czas, aby opracować bez patentu lek przeciwnowotworowy na miarę XXI wieku. Podobnie jak dzisiejszy przemysł farmaceutyczny, przemysł oprogramowania był historycznie zdominowany przez duże firmy i bazy kodu własnościowego. Obecnie najpowszechniej używany system operacyjny na świecie - Android - jest oprogramowaniem typu open source. Każdy może skopiować i dostosować kod do określonych potrzeb lub ulepszyć bazę kodu dla całej społeczności. Podczas eksploracji sieci zobaczysz treści i usługi dostarczane przez projekty open source, takie jak Linux, Wikipedia, WordPress itp., Lub przez nie możliwe. ”
ile lat ma córka Rica Flaira?
Oczekuje się, że Projekt 9DS będzie skuteczny w walce z czerniakiem, rakiem nerki i potrójnie ujemnym rakiem piersi. Przy niewielkich zmianach w cząsteczce związek może być również skuteczny w przypadku większej liczby typów raka. Do tej pory projekt otrzymał zobowiązania na prawie 15 000 USD z jego celu 50 000 USD oraz prawie 2800 USD w bitcoinach; 50 000 $ sfinansuje projekt przez około sześć miesięcy. W tym czasie Yonemoto planuje wyprodukować więcej 9DS i poddać związek badaniu heteroprzeszczepu w celu zmierzenia skuteczności leku przeciwko niektórym liniom raka (co przybierze formę „leczenia raka u myszy”, jak wyjaśnia strona). .
„To kolejny krok w rozwoju leków i ważny krok na drodze do badań klinicznych (na ludziach)” - zauważa Yonemoto. „Jeśli otrzymamy większe fundusze, dodamy ambitne cele, takie jak dalsze eksperymenty przedkliniczne na 9DS, opracowanie analogów 9DS lub inne ekscytujące pomysły przeciwnowotworowe”. Projekt prowadzony przez Yonemoto i Evana Powersa, współtwórcę leku Tafamidis, zapewni niezależny przegląd jego wysiłków. Przewodowy dowiedział się, że Yonemoto zamierza opublikować dane z Project Marilyn otwarcie, prawdopodobnie na GitHub, gdzie programiści rutynowo hostują projekty oprogramowania open source.
Wired's Robert McMillan zauważa również, że taktyka zbierania funduszy Yonemoto jest sprzeczna ze standardową metodą badania leków, ale stanowi powrót do metod badawczych leków z połowy wieku, takich jak szczepionka przeciwko polio, która została opracowana i rozpowszechniona bez ograniczeń patentowych. Yonemoto powiedział McMillanowi, że „Biologia staje się bardziej dyscypliną informatyczną”, a transformacja jest przyspieszona przez postęp technologiczny, taki jak skomputeryzowane sekwencjonowanie ludzkiego genomu.
ile wart jest Stephen kowal?
Chociaż technologia sekwencjonowania całego ludzkiego genomu istnieje dopiero od około 15 lat, silne powiązanie, jakie stworzyła między informatyką a biologią, sprawiło, że naukowcy coraz częściej mogą podchodzić do medycznych projektów badawczych w taki sam sposób, w jaki programiści podchodzą do tego procesu. projektowania dużego systemu oprogramowania. Współzałożyciel Google, Sergey Brin, słynie z tego, że mutację we własnych genach uważa za błąd w swoim osobistym kodzie, a pomysł wykorzystania zdolności obliczeniowych Google do wspomagania badań medycznych kryje się za własnymi badaniami Google, takimi jak badanie podstawowe Google X inne przedsięwzięcia, takie jak Calico, które zajmuje się starzeniem się, chorobami neurodegeneracyjnymi i rakiem.
Badając genetykę, tak jak w przypadku kodu źródłowego, naukowcy korzystają również z niskich kosztów takich rzeczy, jak sekwencjonowanie całego ludzkiego genomu, co teraz kosztuje około 1000 USD , jak wyjaśnił Francis de Souza, prezes Illumina, producenta maszyn do sekwencjonowania DNA na MIT Przegląd technologii Konferencja EmTech. Oszacował, że 228 000 ludzkich genomów zostanie w tym roku zsekwencjonowanych przez naukowców z całego świata i że sekwencjonowanie jest często wykorzystywane do kierowania leczeniem różnych typów raka. Illumina uważa, że rynek szybkich badań DNA może osiągnąć 20 miliardów dolarów rocznie, z czego połowa jest związana z badaniami nad chorobami, takimi jak czerniak, rak płuc czy guzy mózgu.
GeneHub to startup z San Francisco, który uruchomił, a następnie anulował Kampania na Kickstarterze finansowanie społecznościowe uruchomienie usługi oferującej sekwencjonowanie całego genomu osobom fizycznym. (Kampania została odwołana ze względu na znaki towarowe należące do innej firmy genomicznej, która będzie wymagać zmiany marki od GeneHub). Startup nadal zamierza oferować pierwszą dostępną każdemu usługę sekwencjonowania genomu i wyjaśnia swoje motywy:
„W ciągu 11 lat od zakończenia projektu Human Genome Project instytucje akademickie nie poczyniły żadnych postępów w zrozumieniu niesamowitej różnorodności wyrażanej w ludzkim genomie. Ledwo rozumiemy, jak twoje geny cię tworzą. Ten problem nie zostanie rozwiązany w laboratorium, w którym nie ma możliwości udostępniania danych i zamkniętej mentalności „publikuj lub giń”, ale dając tobie i innym genialnym ludziom dostęp do twojego własnego genomu i umożliwiając ci eksplorację, udostępnianie, analizowanie, i kontroluj swój własny genom. „
Chociaż GeneHub ma nadzieję zbudować firmę, oferując sekwencjonowanie genomu jako usługę, jego aspiracje są również zgodne z aspiracjami Yonemoto, aby uczynić dane medyczne bardziej dostępnymi i otwartymi na badania dla różnych osób. W ten sam sposób, w jaki programiści udostępniają swoje oprogramowanie jako otwarte źródło w nadziei, że inni będą mogli rozwinąć jego możliwości dalej i w nowych kierunkach, udostępnienie badań medycznych i genetycznych jako otwarte lub szeroko dostępne może ostatecznie doprowadzić do ważnych odkryć dla naukowców walczących z rakiem i innymi chorobami. .
Ale to nie wcześniej, niż to wyjątkowe skrzyżowanie biologii i informatyki pokonuje kilka wyzwań. Jednym z nich jest problem wizerunkowy: przekonanie, że projekty zdrowotne finansowane przez społeczności pomijają tradycyjny proces recenzowania, który uwiarygodnia twierdzenia naukowe. Projekt Odporności, narzędzie do śledzenia aktywności GoBe i Skaut ze Scanadu potwierdziły tę wątpliwość. Podczas gdy startupy dążą do demokratyzacji informacji i badań medycznych, kluczowe znaczenie będzie dla nich możliwość udowodnienia swoich hipotez i wykazania potencjału swoich leków lub technologii.
Możliwe jest również, że projekty badawcze typu open source będą również musiały znaleźć sposób na zebranie większej ilości pieniędzy niż w ramach finansowania społecznościowego, ponieważ opracowanie i wyprodukowanie leku wymaga ogromnych kwot. Dobrze przeprowadzone inicjatywy, takie jak Projekt Marilyn, służą nie tylko do wykazania naukowej wartości leku lub leczenia, ale mogą przyciągnąć do projektu więcej badaczy i inwestorów. Może to zapoczątkować obiecujące nowe obszary badań i prawdopodobnie skrócić notorycznie długi proces opracowywania i testowania nowych leków i terapii - co oznacza, że kiedy Yonemoto lub inny badacz sfinalizuje kolejny ważny lek przeciwnowotworowy, będą mogli przenieść tę innowację z laboratorium do rzeczywistej -Życie pacjentów trochę szybciej.
Więcej na temat ściągawki technicznej:
- 4 gadżety w tym tygodniu: Open Source House, Smart Pan i nie tylko
- Oto jak firmy technologiczne płacą za całe to bezpłatne oprogramowanie, z którego korzystasz
- Cztery największe gry od przyszłego tygodnia
